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样本制备 · 培养细胞

Western Blot 细胞裂解液制备:确认目标蛋白回收

培养细胞裂解是否合格,应根据目标蛋白回收、蛋白定量兼容性和后续 SDS-PAGE 表现判断。收样后还需注意目标是否留在不溶性沉淀中,以及 DNA 黏度是否影响移液和上样。

实验台手册 · 样本制备

Western blot 细胞裂解与样本准备

需要可溶组分并测定蛋白浓度时,可选 RIPA 提取;需要直接在上样液中制样时,可选 SDS 裂解。下面分别按 Thermo Scientific Pierce RIPA 89900/89901 和 CST 说明列出步骤。

步骤旁的来源标记可跳转到本页末尾的厂商流程与说明书。

本页解决什么问题

RIPA 方法使用 Thermo 89900/89901,适用于培养哺乳动物细胞。说明书给出 HeLa 和 A431 的用量;其他细胞系可从此起步,再检查提取产量。

CST 分支是 6 孔板或 10 cm 皿的直接变性上样流程,适用于不需要先得到可溶蛋白浓度的场景,但不能与澄清后的 RIPA 上清等同。

本页在已标记的澄清上清或热处理 SDS 样本处停止;定量、上胶和转膜见完整流程和湿转手册。

材料与记录

冷 PBS[THERMO-89900]

Thermo 贴壁和悬浮流程都要求用冷 PBS 清洗两次。

Thermo Pierce RIPA 89900/89901[THERMO-89900]

25 mM Tris-HCl pH 7.6、150 mM NaCl、1% NP-40、1% 脱氧胆酸钠、0.1% SDS;到货后 4 °C 保存。

蛋白酶/磷酸酶抑制剂[THERMO-89900]

RIPA 不自带;需要保留蛋白或磷酸化状态时,在使用前立即加入兼容抑制剂。

CST 1× 还原 SDS sample buffer[CST-WB]

CST #7722/#7723:1 体积 3× SDS buffer 加 1/10 体积 30× DTT,再用水稀释至 1×。直接裂解为 6 孔板每孔 100 µL 或 10 cm 皿 500 µL。

细胞刮刀、微量管、冰和离心机[THERMO-89900]

目标分区不确定时,保留沉淀并分别标记。

BCA 兼容定量[THERMO-FAQ]

Thermo 列出 Pierce BCA 兼容;产品 FAQ 说明 RIPA 会产生强 A280 信号,影响浓度和纯度比值。

来源说明的起始数字

窄屏可左右滚动查看完整参数表。

参数起始条件使用说明
RIPA 配方25 mM Tris-HCl pH 7.6;150 mM NaCl;1% NP-40;1% 脱氧胆酸钠;0.1% SDS[THERMO-89900]使用 89900/89901 的公开配方;不能仅凭“RIPA”名称推断商业产品相同。
贴壁比例每 75 cm² 培养瓶、5 × 10⁶ HeLa 或 A431 用 1 mL 冷 RIPA;冰上 5 分钟[THERMO-89900]这是 Thermo 对指定细胞的起始条件。
贴壁澄清约 14,000 × g 15 分钟[THERMO-89900]把上清转到新管;来源流程把沉淀视作碎屑。
悬浮细胞比例每 40 mg 湿沉淀(约 5 × 10⁶ HeLa)用 1 mL RIPA[THERMO-89900]湿沉淀质量是来源条件的一部分。
悬浮细胞收集2,500 × g 5 分钟,PBS 清洗两次;裂解后冰上轻摇 15 分钟[THERMO-89900]记录收集离心与裂解澄清离心,不要混成一个参数。
直接 SDS 分支6 孔板每孔 100 µL 或 10 cm 皿 500 µL;超声 10–15 秒;95–100 °C 5 分钟[CST-WB]这些数值来自 CST,不是 RIPA 替代值。

预计用时与检查要点

收样前

预冷 PBS/RIPA,标记组分,使用前立即加兼容抑制剂。

已记录裂解方法和加入的抑制剂。

贴壁 RIPA

冷洗两次 → 冰上 5 分钟 → 刮取 → 约 14,000 × g 15 分钟。

上清和沉淀分开标记。

悬浮 RIPA

2,500 × g 5 分钟收集/清洗 → 冰上 15 分钟 → 约 14,000 × g 15 分钟。

比例对应湿沉淀或细胞估计。

直接 SDS

清洗 → 在 1× SDS 刮取 → 超声 10–15 秒 → 加热 5 分钟 → 冷却 → 离心 5 分钟。

记录体积并保持分支独立。

RIPA 与直接 SDS 制样步骤

RIPA 与直接 SDS 制样应分开。两者的去污剂会影响蛋白定量、黏度和回收组分,因此每个样本都要注明所用缓冲液。

1 · 选择裂解方法

需要可溶且可定量提取物时选 Thermo RIPA;需要培养皿直接变性上样时选 CST SDS。膜、核或不溶性目标不确定时保留沉淀并写出组分保留计划。

当场检查:裂解前记录表已写明一个分支和一个样本组分。

2A · Thermo RIPA 贴壁细胞[THERMO-89900]

倒去培养基,冷 PBS 清洗两次。每 75 cm²、5 × 10⁶ HeLa 或 A431 加 1 mL 冷 RIPA,轻晃铺匀,冰上 5 分钟。刮取、收集,约 14,000 × g 15 分钟。

当场检查:上清与碎屑沉淀分开;抑制剂及加入时间已记录。

2B · Thermo RIPA 悬浮细胞[THERMO-89900]

2,500 × g 5 分钟收细胞;冷 PBS 清洗两次,并重复 2,500 × g 5 分钟收集。每 40 mg 湿沉淀加入 1 mL RIPA,吹打悬匀,冰上轻摇 15 分钟,约 14,000 × g 15 分钟澄清。

当场检查:湿沉淀质量、缓冲液体积以及两个不同离心阶段都已记录。

2C · CST 直接 SDS 样本[CST-WB]

1× PBS 清洗培养物并吸尽,6 孔板每孔加 100 µL 或 10 cm 皿加 500 µL 新鲜 1× SDS sample buffer。立即刮取、冰上保存,超声 10–15 秒;取 20 µL 加热 95–100 °C 5 分钟、冰上冷却,再微量离心 5 分钟;原厂未指定这一步的离心力,记录实验室实际设置。

当场检查:样本均匀、可吸取;加热分装管的标记清楚。

3 · 保持样本组分分开[THERMO-89900]

RIPA 澄清后把上清移到新管,留下碎屑沉淀。Thermo 可选超声提示明确是对沉淀做 30 秒、50% pulse 处理以提高产量,不是要求每个澄清上清都超声。

当场检查:保留沉淀、沉淀回收和可溶上清分别标记;若尝试回收,记录重悬和再次澄清的方法,不要猜说明书省略的细节。

4 · 单独完成直接 SDS 分支[CST-WB]

CST 加热冷却后要求微量离心 5 分钟再上样;原页面没有指定该步离心力,应记录实验室已验证做法,不要把 RIPA 的 14,000 × g 套进来。

当场检查:CST 直接 SDS 样本与 RIPA 上清分别放在标记清楚的管中。

5 · 对 RIPA 定量并归一化[THERMO-89900]

使用 Thermo 列出兼容的 BCA,记录稀释倍数和浓度。根据目标蛋白的预实验梯度选择上样质量。直接 SDS 记录上样体积和培养皿面积。

当场检查:浓度结果带有测定法、空白和稀释信息。

6 · 分装、标记并保存

分装工作样本并采用实验室已验证保存方法;RIPA 试剂的 4 °C 保存要求不等于裂解物长期保存验证。目标分区不确定时保留沉淀或未处理组分,上胶前标注泳道图。

当场检查:记录中能查到细胞状态、裂解液组成、体积、抑制剂和所取组分。

停止并处理:若相关沉淀已被丢弃,应明确回收问题仍未解决。

两条有效的制样路径

RIPA 得到澄清的可溶组分;直接 SDS 裂解得到含上样液的变性样本。继续上胶前,在标签中保留制样方法。

培养细胞选择一种裂解方法Thermo RIPA澄清 → BCA → LaemmliCST 直接 SDS超声 → 加热 → 记录体积标记组分 → 上胶记录裂解方法

计算示例

比例算例:2.5 × 10⁶ HeLa 细胞

Thermo 的起始比例是 5 × 10⁶ HeLa/A431 对应 1 mL。若准确估计 HeLa 样本为 2.5 × 10⁶ 细胞,线性缩放得到一个数学起点,并不证明提取产量相同。

1,000 µL × (2.5 × 10⁶ ÷ 5 × 10⁶) = 500 µL 冷 RIPA。

记录细胞估计法和实际体积。若浓度过低,说明书允许直接皿上裂解时用更少缓冲液;先用小体积做预实验,并记录目标蛋白的回收情况。

避免得到无法解释的裂解物

  • RIPA 在规定的冰上孵育期间保持低温;批号和抑制剂加入时间已记录。
  • 记录培养面积或湿沉淀质量,使缓冲液体积可追溯到来源比例。
  • RIPA 澄清上清和沉淀没有在未说明的情况下重新混合。
  • BCA 使用去污剂兼容方法和匹配空白;不把 A280 当作通用 RIPA 浓度读数。
  • 不要把直接 SDS 与 RIPA 按“上样体积相同”理解为蛋白质量相同。

裂解物看起来不对时

RIPA 裂解物拉丝、难吸取[THERMO-89900]

解释

核酸或破碎不足可能影响黏度,但仅凭它不能确定缺失目标在哪个组分。

下一步

记录黏度、保留组分并选择兼容目标的破碎方法。Thermo 的 30 秒/50% pulse 是沉淀回收选项,不是所有裂解物的万能处理。

磷酸化信号异常弱[THERMO-89900]

解释

RIPA 产品不含磷酸酶抑制剂,处理过程中可能丢失磷酸化。

下一步

在使用前立即加入兼容磷酸酶抑制剂并减少升温时间;不要直接声称目标蛋白不存在。

沉淀被丢弃但膜蛋白目标缺失[THERMO-89900]

解释

目标可能留在不溶部分;RIPA 上清不等于总回收。

下一步

保留沉淀重复,并测试有验证依据的分级或增溶分支。

直接 SDS 泳道过载或无法吸取[CST-WB]

解释

培养皿体积和上样孔/样本状态不匹配。

下一步

记录实际体积,按 CST 加热后澄清,并调整下一次样本输入;不要把它改称 RIPA。

FAQ

Thermo 比例适用于每种细胞系吗?[THERMO-89900]

不适用。说明书用 HeLa 和 A431 给出 5 × 10⁶ 细胞示例;其他细胞系应把它作为起始条件并记录实际回收。

抑制剂可以前一天加入吗?[THERMO-89900]

Thermo 要求在使用前立即加入蛋白酶和磷酸酶抑制剂;除非抑制剂说明另有兼容方案,应遵循该时间。

为什么保留沉淀?[THERMO-89900]

RIPA 上清只是当前方法得到的可溶组分;保留沉淀可以检验缺失目标是否仍在不溶部分。

CST 的 20 µL 是统一上样量吗?[CST-WB]

不是。CST 在 10 × 10 cm 胶示例中给出 20 µL;孔容量、浓度和目标丰度仍需决定实际体积。

厂商流程与说明书

每项条件旁的来源标记均链接到相应厂商说明。

  1. THERMO-89900 · Thermo Scientific — RIPA Lysis and Extraction Buffer (89900/89901), MAN0011565 Rev. B.0

    第 1–2 页:配方、HeLa/A431 比例、贴壁冰上 5 分钟/悬浮 15 分钟、约 14,000 × g 15 分钟、可选沉淀超声及抑制剂加入时间。

  2. THERMO-FAQ · Thermo Scientific — RIPA 89900/89901 Product FAQs

    89900/89901 产品 FAQ:RIPA 的强 A280 吸收、兼容比色测定和抑制剂时间。

  3. CST-WB · Cell Signaling Technology — Western Blotting Protocol

    B 节:直接 SDS 的体积、超声、加热和上样;A/C/D 节:0.2 µm NC、封闭/稀释液、100 cm² 膜面积对应体积,以及指定 HRP/ECL 条件。

记录结果与相关指南

保存实验条件、原始图像和结果判断。下方提供记录单,以及制样、上样、转膜和定量的相关指南。