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从现象到证据

Western Blot 诊断案例库

每个案例从观察现象出发,明确需要什么证据来区分竞争性原因。当前是教学框架,不声称本站完成了对应实验。

案例阅读规则

原因按“需要优先验证”排序,不代表概率已经由真实数据计算。每张配图均为本站原创教学示意图,用于呈现证据关系,不是原始实验数据,也不替代阳性或阴性对照。

案例 1

整膜无信号,且膜上几乎没有总蛋白

观察:目标、内参和阳性对照都没有信号;转膜染色显示各泳道几乎没有蛋白。

转膜失败的证据对比
原创教学图

转膜失败的证据对比

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 未裁切整膜图
  • 转膜后胶或总蛋白染色
  • 夹层方向和电极记录
  • 转膜电流/电压记录

优先验证的原因

  1. 1. 夹层或极性装反
  2. 2. 电接触不良或转膜液失效
  3. 3. 大范围气泡或接触不良

下一步区分性动作

保持抗体和检测条件不变,重新转膜,并记录夹层方向和总蛋白染色。

不能仅凭当前现象得出的结论

只有一张空白抗体图,无法区分转膜失败和检测失败。

案例 2

内参正常,但大分子目标蛋白很弱

观察:常规内参条带清晰,但高分子量目标缺失或明显偏弱。

大分子目标转膜不足的证据
原创教学图

大分子目标转膜不足的证据

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 验证过的阳性样本
  • 未裁切膜上的目标分子量区域
  • 高分子量区域的转膜染色
  • 条件允许时检查转膜后胶

优先验证的原因

  1. 1. 大分子目标转膜不足
  2. 2. 目标所在组分提取不充分
  3. 3. 表达量低或取样时间不合适

下一步区分性动作

先加入验证过的阳性对照并检查转膜证据,再决定是否调整一抗。

不能仅凭当前现象得出的结论

小分子内参正常不能证明大分子目标一定完成了有效转膜。

案例 3

整体转膜尚可,但小分子目标消失

观察:多数蛋白可以转膜,预期低分子量目标却缺失或重复性差。

小分子蛋白转膜丢失
原创教学图

小分子蛋白转膜丢失

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 膜孔径
  • 转膜时间和甲醇浓度
  • 转膜后胶
  • 验证过的小分子阳性对照

优先验证的原因

  1. 1. 穿膜或膜保留不足
  2. 2. 目标位于裁图范围之外
  3. 3. 抗体不兼容或目标丰度过低

下一步区分性动作

保持抗体条件不变,比较更短转膜或 0.2 µm 膜。

不能仅凭当前现象得出的结论

低分子量位置无条带,并不能单独证明发生了穿膜。

案例 4

整张膜均匀发黑

观察:膜整体呈灰黑色,只有很短曝光时才能看清有用条带。

均匀高背景与曝光条件对比
原创教学图

均匀高背景与曝光条件对比

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 多个曝光时间
  • 二抗稀释和物种
  • 底物配制记录
  • 洗膜体积和时间

优先验证的原因

  1. 1. 二抗过浓
  2. 2. 过曝或底物污染
  3. 3. 洗膜不足或膜曾干燥

下一步区分性动作

保持一抗条件不变,先只改变二抗浓度或曝光中的一个。

不能仅凭当前现象得出的结论

仅凭外观不能证明封闭不足是主要原因。

案例 5

预期位置之外反复出现额外条带

观察:预期条带存在,但多次实验都出现一个或多个额外条带。

额外条带的对照证据
原创教学图

额外条带的对照证据

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 敲除/敲低或已知阴性样本
  • 已知异构体和加工形式
  • 识别另一表位的独立抗体
  • 样本降解记录

优先验证的原因

  1. 1. 真实异构体、剪切或翻译后修饰
  2. 2. 一抗交叉反应
  3. 3. 降解或内源免疫球蛋白信号

下一步区分性动作

先使用遗传阴性对照或正交抗体,再判断额外条带是否为非特异性。

不能仅凭当前现象得出的结论

仅凭分子量不能确定额外条带是生物学现象还是技术伪影。

案例 6

高上样量伴随整道拖尾和泳道变宽

观察:泳道边界不清,信号沿垂直方向扩散,且高浓度样本最明显。

上样量增加与拖尾演变
原创教学图

上样量增加与拖尾演变

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 上样量梯度
  • 裂解液黏度和澄清记录
  • 盐和去污剂组成
  • 冻融历史

优先验证的原因

  1. 1. 上样过量
  2. 2. 裂解液黏稠或澄清不足
  3. 3. 降解或与凝胶体系不兼容

下一步区分性动作

保持抗体条件不变,先重跑一组较低上样量梯度。

不能仅凭当前现象得出的结论

高度修饰蛋白也可能产生真实拖尾,需要结合生物学证据。

案例 7

局部空白区与转膜气泡相符

观察:膜上固定位置出现边界清楚的浅色区域,并横跨相邻泳道。

转膜气泡与位置对应
原创教学图

转膜气泡与位置对应

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • Ponceau 或总蛋白图
  • 夹层照片或组装记录
  • 不同目标是否在同一位置异常
  • 膜和滤纸检查

优先验证的原因

  1. 1. 胶与膜之间有气泡
  2. 2. 滤纸折叠或破损
  3. 3. 夹层压力不均

下一步区分性动作

重新组装并逐层彻底排泡,在抗体孵育前先检查整张膜。

不能仅凭当前现象得出的结论

位置依赖的信号缺失不能解释成样本特异的生物学差异。

案例 8

内参饱和导致错误归一化

观察:各泳道内参都呈同样的纯黑条带,而目标差异看起来很大。

信号饱和与归一化偏差
原创教学图

信号饱和与归一化偏差

原创教学示意图,将膜图外观与需要核对的证据放在同一视图中。

需要收集的证据

  • 更短曝光系列
  • 原始像素饱和检查
  • 蛋白上样量梯度
  • 总蛋白归一化图

优先验证的原因

  1. 1. 内参超出线性范围
  2. 2. 目标和内参使用了不兼容的曝光条件
  3. 3. 处理条件下内参并不稳定

下一步区分性动作

调整曝光或上样量,使目标和归一化信号都处于经过验证的线性范围。

不能仅凭当前现象得出的结论

内参看起来同样黑,在饱和情况下并不能证明各泳道上样一致。

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