WBWestern Blot Hub

实验流程

Western Blot 完整流程:从样本制备到成像定量

本页适用于常规变性 Western Blot。具体参数仍应以所用抗体、凝胶、膜、转膜设备和成像系统说明书为准;通用条件只作为实验起点。

开始前需确认

  • 目标蛋白及预期表观分子量,包括已知异构体、剪切或加工形式。
  • 样本类型、亚细胞定位、预期丰度和合适的取样时间点。
  • 还原和加热条件是否会影响目标表位或蛋白状态。
  • 阳性生物学对照、阴性对照,以及上样和归一化方案。
  • 抗体供应商验证过的样本、稀释液、稀释倍数和预期条带模式。
  • 检测方式,以及如何保存未饱和、可用于定量的原始图像。

实验步骤

1. 取样与裂解

建议起点

研究易降解蛋白或磷酸化等易变修饰时,应尽量低温、快速处理。根据目标蛋白所在组分选择裂解方法,并按已验证流程加入蛋白酶或磷酸酶抑制剂。

检查结果

检查裂解是否充分、样本是否明显黏稠,以及目标是否可能仍留在不溶性组分中;蛋白定量方法需与当前裂解液兼容。

需要调整时

膜蛋白、核蛋白、不溶性蛋白或目标回收率偏低时,应调整裂解体系或考虑组分分离。单纯增加上样量不能解决提取不足。

2. 制备电泳样品

建议起点

按计划的蛋白量配样,尽量让各泳道最终盐、去污剂、上样液和还原剂组成接近,并采用目标蛋白和凝胶体系可接受的加热条件。

检查结果

记录每道蛋白质量和液体体积;注意是否出现沉淀,以及不同样本的盐或去污剂负荷是否差异过大。

需要调整时

上样量没有经过验证时,可先做上样梯度。若某些目标在强烈加热后聚集,只在有明确依据时比较替代加热条件。

3. SDS-PAGE 分离

建议起点

根据目标分子量和需要分开的邻近条带选择凝胶体系、浓度或梯度胶,并控制上样量,保证泳道不过载,同时加入分子量 Marker。

检查结果

观察染料前沿、Marker 和泳道形态。Marker 正常而样品泳道变形时,优先检查样本和上样条件;整张胶一起变形时,优先检查凝胶、缓冲液和运行条件。

需要调整时

凝胶分离范围应以具体产品或体系说明为准。出现明显 smiling、泳道变形或整道拖尾时,先解决电泳问题再进入转膜和抗体优化。

4. 转膜

建议起点

组装胶膜夹层时排净气泡。NC 膜按说明直接在水或转膜液中润湿;PVDF 按膜供应商要求预润湿。电参数优先遵循具体转膜设备说明书。

检查结果

封闭前用 Ponceau S 或其他兼容的总蛋白染色检查整张膜;怀疑转膜不足时,同时保留并检查转膜后的胶。

需要调整时

大分子蛋白常需要更充分的转膜时间和散热,有些体系还会调整甲醇;小分子蛋白则要警惕穿膜,可比较更短转膜或 0.2 µm 膜。调整方向应由转膜结果决定。

5. 封闭与一抗稀释液选择

建议起点

奶粉或 BSA 都可用于部分 Western Blot 体系。具体抗体如果给出了验证过的封闭液或一抗稀释液,应优先照产品说明执行。

检查结果

膜封闭液和一抗稀释液要分开记录。磷酸化抗体不能一概而论地禁用奶粉,也不能默认 BSA 一定更合适。

需要调整时

信号或特异性不佳时,先核对供应商推荐的稀释液,再调整抗体浓度。封闭剂、抗体浓度和洗膜条件尽量不要在同一轮同时改变。

6. 一抗孵育

建议起点

从供应商验证过的稀释倍数、稀释液和孵育条件开始;产品对时间和温度有明确要求时按说明执行。

检查结果

孵育过程中保持膜完全浸润,不能干燥。记录膜方向、裁切位置和各目标所在区域。

需要调整时

确认目标表达、转膜和检测均无明显问题后,再围绕已验证条件做小范围滴定。增加一抗可能提高背景,不能补回样本中不存在的目标。

7. 洗膜与二抗孵育

建议起点

使用新鲜洗液、足够体积并充分摇动。二抗需匹配一抗宿主和所用检测系统。

检查结果

记录洗膜液、时长和摇动方式;确认二抗标记与检测化学兼容,并参考底物或成像系统对二抗用量的要求。

需要调整时

整张膜均匀发黑时,优先检查二抗浓度、曝光、污染和洗膜,再判断是否需要修改一抗条件。

8. 检测、成像与定量

建议起点

使用状态正常的底物或正确的荧光采集设置,采集足够的曝光以识别饱和,并保存未裁切原始数据。

检查结果

计算比值前,确认目标和归一化信号均未饱和,并处于共同可用的样本范围;所用内参还需要在当前实验条件下保持稳定。

需要调整时

目标或归一化信号超出可用范围时,应调整样本量、抗体或采集条件后重新测量。饱和条带不宜直接用于定量,也不能靠后期调图恢复线性。

建议至少设置的对照

阳性生物学对照

确认当前样本制备、抗体和检测条件能够得到预期条带。

阴性/敲除样本

敲除、敲低或已知阴性样本可用于判断条带是否随目标蛋白变化。

不加一抗对照

用于检查二抗和底物产生的背景,但不能单独证明一抗特异性。

上样/归一化对照

优先选择在当前处理条件下已验证稳定的内参;合适时也可采用总蛋白归一化。

转膜检查

Ponceau S 或其他总蛋白图可帮助判断问题出在转膜还是后续抗体检测。

每次实验建议记录

样本来源、处理时间点、裂解液及抑制剂

蛋白定量方法、浓度、每孔上样量和加热条件

凝胶体系、浓度、运行电压和时间

膜类型/孔径、转膜体系、时间、电流或电压

膜封闭液、一抗稀释液、抗体货号/批次和稀释倍数

洗膜液、次数、时长和二抗条件

底物或荧光通道、曝光和仪器设置

原始整膜图、线性/饱和证据和归一化规则

本页主要依据

查看完整参考资料和维护说明 →

原创教学图

实验流程与检查图示

以下为教学示意图,用于说明实验步骤和判断方法,不属于实验原始数据。

Western Blot 八步流程总览
原创教学图

Western Blot 八步流程总览

按样本裂解、定量、跑胶、转膜、封闭、抗体孵育、成像与定量八个步骤展示主要操作和检查项目。

大分子与小分子蛋白的转膜风险
原创教学图

大分子与小分子蛋白的转膜风险

对比大分子转膜不足与小分子穿膜或膜上保留不足,并标出相应的检查方法。